Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO38Q6PIJ6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms