Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms