Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM46CQ5VWP2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms