Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms