Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms