Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms