Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms