Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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