Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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