Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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