Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PDCD1Q15116 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PDCD1Q15116 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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