Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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