Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms