Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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