Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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PMS2P11Q13670 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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