Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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