Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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