Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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