Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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