Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TWF1Q12792 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TWF1Q12792 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TWF1Q12792 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TWF1Q12792 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TWF1Q12792 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TWF1Q12792 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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