Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSRP1Q08945 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms