Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms