Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN1BQ07699 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN1BQ07699 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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