Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms