Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms