Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDC42EP1Q00587 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms