Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC7A9P82251 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms