Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1S1P61966 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms