Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms