Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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