Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME5P56597 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME5P56597 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME5P56597 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms