Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms