Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NMUP48645 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NMUP48645 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NMUP48645 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms