Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLCP48506 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLCP48506 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLCP48506 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLCP48506 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms