Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms