Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MDH1P40925 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MDH1P40925 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms