Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPGP40121 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms