Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms