Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA6P31267 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms