Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTKP29376 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTKP29376 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTKP29376 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTKP29376 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTKP29376 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTKP29376 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTKP29376 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LTKP29376 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTKP29376 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms