Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX2P28328 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms