Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2AP28223 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2AP28223 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2AP28223 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HTR2AP28223 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms