Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms