Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGFR3P22607 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms