Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms