Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSLP07711 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSLP07711 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSLP07711 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms