Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms