Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms