Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms