Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC01387J3KSC0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC01387J3KSC0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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